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TOC分析通常分为直接测定法和间接测定法。直接测定法一般是通过将无机碳（IC）除去后测定全碳（TC）的方法，适用于测定IC含量高的水样，但容易损失水样中挥发性的有机碳（POC）。 IC的处理方法采用酸化曝气处理法，将水样酸化至pH3，CO32-和HCO3-转化成碳酸，产生二氧化碳，再通过曝气去除CO2。由于在曝气过程中会造成水样中挥发性有机物（VOC）的损失，因此直接法的测定结果仅能代表不可吹出的有机碳（NPOC）含量。样品中无机碳含量较高时，因其干扰对有机碳的测定，所以必须消除废水中无机碳的干扰，在测定前要对样品进行预处理。在间接测定法中，TOC是通过TC减去IC得到，将所有的碳氧化得到TC，IC则是通过测定样品经酸分解的CO2量得到的，适用于测定IC比TOC低的水样。 
差减法存在以下几方面的不足： （1）差减法对水样进行两次测定，分别得出IC和TC，所以要求配备一个外接采样器，以保证IC和TC测定时的水质一致，这在污染物有时空分布的情况下，是很难做到的； （2）由于要分别测定水样的IC和TC，故在仪器标定时也同样要求IC和TC两种标样，这样就增加了仪器的复杂程度； （3）测量周期较长； （4）对产生的CO2量进行两次积分测量增大了仪器的误差。 氧化技术：测定TOC时使用的氧化有机污染物的方法分为干法氧化和湿法氧化两类，更具体来说，主要有以下几种：高温催化燃烧氧化、过硫酸盐氧化、紫外光（UV）/过硫酸盐氧化、紫外光（UV）氧化等。干法氧化（高温催化燃烧氧化）的特点是检出率较高，氧化能力强，操作简单、快速。湿法氧化特点是准确度高、进样量大、灵敏度高、安全性能好，但费时。
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