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对有硝化作用的污水处理系统的出水进行BOD5测定时，由于其中含有很多硝化细菌，测定结果中就包含了氨氮等含氮物质的需氧量。
当需要区分水样中含碳物质的需氧量和含氮物质的需氧量时，可采用在稀释水中加入硝化抑制剂的方法消除BOD5测定过程中的硝化作用，比如在每升稀释水中加入10mg2-氯-6-(三氯甲基)砒啶或10mg丙烯基硫脲等。
BOD5/CODCr接近1甚至大于1，往往说明检测过程出现了差错，必须对检测的每个环节进行审核，尤其要注意水样取用是否均匀。而BOD5/CODMn接近1甚至大于1却可能是正常的，因为高锰酸钾对水样中有机组分的氧化程度要比重铬酸钾低很多，同一水样的CODMn值有时会比CODCr值低很多。
当出现规律性的稀释倍数越大、BOD5值越高的现象时，原因通常是水样中含有抑制微生物生长繁殖的物质。稀释倍数低时，水样中所含抑制物质的比例就越大，使细菌无法进行有效的生物降解作用，导致BOD5的测定结果偏低。此时应查找抑菌物质的具体成分或原因，测定前进行有效地预处理予以消除或掩蔽。
BOD5/CODCr偏低时，比如低于0.2甚至低于0.1，如果测定的是工业废水，可能因为水样中的有机物可生物降解性很差，但如果测定的水样是城市污水或混有一定比例生活污水的工业废水，除了因为水样中含有化学毒性物质或抗菌素外，比较常见的原因是pH值非中性和存在余氯类杀菌剂等。
为避免失误，在BOD5的测定过程中，水样和稀释水的pH值一定要分别调节到7和7.2，对有可能存在余氯等氧化剂的水样，要作例行检查。
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